Uzroci muškog infertiliteta su brojni i raznoliki, iako u većini slučajeva poremećaj spermatogeneze ostaje nepoznat.

Najčešći poznati uzroci poremećaja produkcije, maturacije, i toka spermatozoida su:

• Infektivni razlozi
• Endokrini poremećaju (Kalmanov sindrom, poremećaji hipofize, …)
• Imunološki poremećaji (autoimuno oštećenje testisa)
• Stil života i faktori životne sredine (toksini, pušenje, …)
• Genetski poremećaji (Cistična fibroza, Klinefelterov sindrom, Delecije Y hromozoma,…)
• Anatomske abnormalnosti (obstruktivni poremećaji genitalnog trakta, skrotalne varikokele)
• Sindrom nepokrtnih cilija
• Bolesti jetre, bubrega, i brojni drugi razlozi

Zbog drugih zdravstvenih rizika po muškarca koji su neretko udruženi sa problemom infertiliteta (pre svega onkoloških) savetuje se da svaki muškarac sa poremećajem spermatogeneze prođe kompletnu urološku dijagnostiku, poželjno od strane lekara urologa – androloga, nakon čega se upuštamo u dalje metode lečenja steriliteta.

Faktori rizika za muški infertilitet su:

• Upalni procesi – prostatitis i genitalne infekcije
• Trauma ili torzija testis
• Prevremeno ili zakasnelo vreme pojavljivanja puberteta
• Brojni toksini iz radne ili životne sredine kao što su olovo, kadmijum, živa, etilen oksid, vinil hlorid, X zraci i druga radioaktivnost
• Pušenje duvana i marihuana
• Prevelika konzumacija alkohola
• Izloženost genitalija visokim temperaturama
• Operacije hernije (ingvinalne kile)
• Nespušteni testis
• Zaušci nakon puberteta
• Upotreba DES i sličnih preparata od strane majek u trudnoći
• Lekovi za ulkusnu bolest, psorijazu
• Stres, težak fizički rad i brojni drugi faktori